Cet article a été publié pour la première fois par l'éditeur du blog sur les questions de santé publique sur GOV.UK. Lisez l'article original ici .
L'une des fonctions principales de Santé publique Angleterre est la surveillance des maladies - s'assurer que nous avons les bonnes informations à notre disposition au bon moment pour éclairer les décisions et les actions à travers le système de santé publique.
La surveillance implique la collecte d'une grande variété de données sur une maladie à partir de diverses sources, afin de nous fournir une connaissance de la situation.
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Nous devons comprendre les régions du pays qui sont les plus touchées par une flambée de maladie, si des groupes particuliers de personnes sont touchés, si les symptômes deviennent plus graves et quand la flambée a peut-être atteint un pic. Il est ensuite utilisé pour informer l'action de santé publique pour aider à prévenir et à contrôler la maladie.
Et la surveillance fournit également des données à la disposition des modélisateurs - des scientifiques qui visent à prédire la progression des épidémies en fonction de différents scénarios.
Ce blog se concentrera uniquement sur COVID-19, mais il est important de savoir que la surveillance fait partie intégrante du travail quotidien de PHE. Vous pouvez lire notre approche de suivi de la grippe saisonnière dans ce blog récent.
Surveillance COVID-19
Pour aider à comprendre la propagation de Covid-19, PHE utilise une grande variété de données en temps réel à la fois au niveau local et national, et afin de maintenir le système de santé publique au courant des données que nous avons été la collecte, nous sommes maintenant publions un rapport de surveillance hebdomadaire et une infographie hebdomadaire .

Dans ce blog, nous voulons expliquer ce que contient le rapport, en exposant la combinaison de données que nous utilisons en se basant à la fois sur des cas de coronavirus confirmés par les laboratoires, mais aussi sur la «surveillance syndromique», qui utilise des données de santé anonymisées en temps réel recueillies auprès d'un large éventail de sources, comme les médecins généralistes, les hôpitaux ou même les recherches Google.
Les systèmes de surveillance sont choisis de manière à pouvoir être mesurés régulièrement et de manière cohérente. Aucune donnée unique ne raconte toute l'histoire d'une épidémie, et aucun système ne peut fournir un chiffre définitif pour combien de personnes pourraient avoir le COVID-19, car beaucoup auront une maladie bénigne et ne la rapporteront jamais aux services de santé.
En rassemblant un large éventail de données, nous pouvons porter des jugements bien informés sur les tendances émergentes, les variations géographiques et les groupes de personnes les plus touchés.
Cas confirmés en Angleterre
Notre rapport de surveillance hebdomadaire comprend une page sur les cas confirmés en laboratoire de COVID-19 en Angleterre qui comprend une ventilation par âge / sexe. Une courbe épidémique montrant la progression des cas dans le temps est également incluse dans l'infographie.
Les données sont indiquées par la date à laquelle l'échantillon a été prélevé sur la personne testée, plutôt que par la date à laquelle le laboratoire a effectué les tests et envoyé les données à PHE. Bien que cela donne l' analyse la plus précise de la façon dont les cas progressent dans le temps, cela signifie que les chiffres des derniers jours sont généralement incomplets - donc cela ne devrait pas être considéré comme une baisse soudaine et importante des cas.
Il est également important de se rappeler que la plupart des tests à ce jour ont été proposés aux personnes hospitalisées ayant un besoin médical ainsi qu'aux travailleurs clés du NHS, plutôt qu'à la population générale, dont beaucoup présentent des symptômes bénins. Les cas confirmés représentent donc la population typique de personnes atteintes d'une maladie grave, plutôt que tous ceux qui sont infectés.
Il s'agit d'un total hebdomadaire plutôt que de la dernière mise à jour quotidienne, donc pour rester à jour avec les cas confirmés quotidiennement, veuillez utiliser notre tableau de bord , qui est mis à jour chaque après-midi.
Notre rapport de surveillance décompose également les cas confirmés de COVID-19 par centre PHE ( PHE a neuf centres basés à travers le pays ) et par région du NHS.
Surveillance communautaire
PHE dispose d'un réseau d'équipes de protection de la santé à travers le pays composé de scientifiques et d'experts formés pour gérer les flambées de maladies infectieuses. Ces équipes sont constamment à la recherche d'épidémies dans des lieux comme les écoles ou les maisons de soins et la collecte de ces informations est vitale à la fois au niveau local et pour informer notre riposte nationale.
Le rapport de surveillance hebdomadaire rassemble les informations fournies par nos équipes de protection de la santé telles que toute «épidémie respiratoire aiguë» en milieu communautaire, y compris les cas où le coronavirus a été confirmé.
À mesure que nous quittons la saison hivernale et que les infections comme la grippe deviennent moins fréquentes, nous nous attendons à ce que la plupart des éclosions en milieu communautaire soient liées au COVID-19 (une «éclosion» est définie comme deux personnes ou plus souffrant d'une maladie similaire, qui semble être lié à un lieu).
Cependant, nous savons également que tous ceux qui reçoivent COVID-19 ne signaleront pas nécessairement leurs symptômes à un médecin ou au téléphone NHS 111, mais beaucoup pourraient se tourner vers Internet pour trouver des informations et des conseils pour accélérer leur rétablissement.
Notre surveillance basée sur Internet suit les volumes de personnes recherchant des symptômes typiques de coronavirus sur des moteurs de recherche comme Google, et nous recherchons des preuves que le nombre de ces recherches augmente au-dessus des niveaux attendus.
Enfin, notre enquête en ligne sur la grippe est réalisée par le public et suit les symptômes respiratoires autodéclarés. L'outil a maintenant été adapté pour surveiller la prévalence dans la communauté et la tendance des symptômes liés à Covid-19.
Surveillance des soins primaires
Notre activité de surveillance comprend une gamme de données soumises par des médecins généralistes à travers le pays.
Le système PHE GP in-hours surveille le nombre quotidien de consultations GP où les patients ont présenté une gamme de symptômes respiratoires, y compris des cas de COVID-19. Ce programme couvre très largement la population de l'Angleterre avec environ 4 500 chirurgies généralistes (couvrant une population de patients d'environ 40 millions) qui en rendent compte chaque jour.
Et notre système de GP en dehors des heures de bureau surveille le nombre de visites quotidiennes imprévues et d'appels aux services de GP en dehors des heures en Angleterre, en particulier le soir, la nuit, le week-end et les jours fériés, là encore où les patients signalent qu'ils présentent des symptômes respiratoires. .
Ensemble, ces programmes fournissent des informations vitales à travers le pays sur le nombre de personnes qui présentent les signes et symptômes du coronavirus.
Micrographie électronique à transmission colorée (MET) d'une particule de coronavirus SARS-CoV-2 isolée d'un cas britannique de la maladie Covid-19. SARS-CoV-2.
Il est important de souligner qu'en examinant ces chiffres, nous tenons compte du fait que les conseils officiels du gouvernement ont exhorté les personnes qui pensent avoir un coronavirus à contacter NHS 111 ou à visiter nhs.net, plutôt que d'aller chez leur médecin généraliste.
Les programmes de soins primaires (GP) ci-dessus nous offrent des données basées sur le jugement clinique des médecins généralistes qui enregistrent si leur patient a présenté une maladie respiratoire. Mais nous gérons également un programme de soins primaires qui implique des tests de laboratoire sur les patients.
Le schéma d'écouvillonnage du RCGP prévoit que les médecins généralistes prélèvent des écouvillons sur les patients ou demandent aux patients de se nettoyer eux-mêmes lorsqu'ils consultent un médecin généraliste pour des symptômes respiratoires - cela provient d'un échantillon d'environ 200 cabinets médicaux. Cela nous fournit un test de «taux de positivité», que nous pouvons surveiller semaine par semaine, par âge et par région pour voir si la proportion de personnes avec COVID-19 confirmé augmente. Ce système de surveillance fournit un aperçu supplémentaire car, contrairement aux tests à l'hôpital, il offre des informations sur les maladies respiratoires plus bénignes observées dans la communauté.
Surveillance des soins secondaires
Nous collectons également des données de surveillance auprès des hôpitaux à travers le pays et vous trouverez des informations à ce sujet dans le rapport hebdomadaire.
Notre système de surveillance syndromique des services d'urgence surveille le nombre de visites quotidiennes (de personnes souffrant de maladies respiratoires) à un réseau d'environ soixante-dix services d'urgence à travers l'Angleterre.
Nous avons également mis en place un système appelé système de surveillance des hospitalisations COVID-19 en Angleterre, ou «CHESS», avec plus de 130 hôpitaux participants et d'autres en ligne tout le temps. Il est recommandé que tous les patients atteints d'infections respiratoires graves dans ces hôpitaux soient testés pour le coronavirus et les résultats communiqués à PHE.
CHESS a été créé spécifiquement à des fins de surveillance et est utilisé pour nous aider à estimer le taux quotidien de nouvelles admissions à l'hôpital pour les personnes atteintes de COVID-19, il peut donc différer d'autres chiffres publiés tels que le nombre total de personnes actuellement hospitalisées avec COVID- 19.
Surveillance virologique
Notre rapport de surveillance hebdomadaire contient des informations provenant du projet de datamart respiratoire. Il s'agit d'un important outil de surveillance en laboratoire pour surveiller les principaux virus respiratoires circulant en Angleterre.
Nous analysons des échantillons provenant d'une sélection de PHE et des laboratoires associés du NHS basés dans toutes les régions du pays et publions le pourcentage de tests positifs pour COVID-19 dans le rapport. Les changements dans la proportion de tests positifs sont un indicateur précoce important des changements dans l'incidence de l'infection.
Surveillance de la mortalité
Notre rapport comprend les chiffres des personnes qui ont été hospitalisées avec COVID-19 confirmé en Angleterre et qui sont décédées. Nous rapportons actuellement les données publiées du NHS.
Le rapport examine également la «surmortalité toutes causes», qui permet de déterminer si le nombre de décès, quelle qu'en soit la cause, survenant dans le pays est supérieur au niveau attendu pour cette période de l'année. Il s'agit d'un indicateur important des décès qui peuvent être dus à COVID, mais où l'infection peut ne pas être diagnostiquée ou confirmée. Il peut également indiquer des décès dus à d'autres causes, où l'infection par COVID peut être un contributeur. Pour plus d'informations sur les décès enregistrés chaque semaine (en Angleterre et au Pays de Galles). visitez le Bureau des statistiques nationales .
Situation internationale
La dernière section de notre rapport comprend des cas confirmés de COVID-19 dans le monde, y compris le nombre total de décès.
Futures sources de données
Notre rapport de surveillance hebdomadaire et notre tableau de bord de données continueront d'évoluer à mesure que de nouvelles données seront disponibles. Par exemple, nous prévoyons d'inclure des données sur l'origine ethnique dans les prochains rapports.
Des opportunités de collecter des données anonymisées émergeront des différents piliers de la stratégie de test du gouvernement et de nouveaux outils et applications tels que le tracker d'état du NHS et les systèmes utilisés pour intensifier le suivi des contacts.
Continuez à consulter nos rapports de surveillance hebdomadaires, qui sont publiés tous les jeudis sur GOV.UK.
(Crédit photo: Unsplash)

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